产品说明
尿嘧啶DNA糖苷酶(Uracil N-Glycosylase,UNG)又名Uracil-DNA Glycosylase(UDG), 为来源于E. coli ung基因的重组表达蛋白,分子量为26kDa。它可催化含尿嘧啶的单链和双链DNA(长度大于6个碱基)释放游离尿嘧啶,但对RNA无活性。 UNG主要应用于PCR扩增产物的防污染,作用原理为:如果在PCR反应中以dUTP替代dTTP掺入DNA中,形成了含dU碱基的PCR扩增产物,该酶能选择性断裂单链和双链DNA中U基的糖苷键,降解该PCR扩增产物。
由于大肠杆菌 UDG经高温失活,降温到低温后,活性会部分恢复;因此不建议将本酶用于防止 PCR扩增产物的交叉污染。建议利用本公司的热敏 UDG(目录号 AE1102)进行防止 PCR扩增产物的交叉污染。
本公司Ec UDG是重组表达,并经多步纯化制备的重组蛋白。
单位定义
一个活性单位为每分钟从含有尿嘧啶的双链DNA(dU/dA碱基对)中催化释放60 pmol尿嘧啶所需酶的量。
活性测定条件
Taq PCR Buffer:10 mM Tris-HCl (pH 8.3, 25°C),20 mM KCl, 10 mM (NH4)2SO4,0.01% Tween 20,1.5 mM MgCl2 中,37℃温育。
浓度:5U/μl
保存条件:-20℃可保存2年,避免反复冻融。
特点
Ø 活性测定buffer为Taq酶Buffer,与多种反应buffer兼容
Ø 虽然本酶高温热处理会失活,但降至低温后活性会部分恢复
Ø 不建议本酶用于防止PCR 扩增产物的交叉污染。
应用
Ø 去除单链或双链DNA中的尿嘧啶碱基
Ø 去除以前累积的PCR扩增的dU-DNA残存污染
产品包装规格及组成
Component | AE1101A | AE1101B |
EcUDG | 200U | 1kU |
10×UDG Buffer | 0.2ml | 1.0ml |
质量控制
经过严格的质控检测,确保该产品具有最高的活性和纯度。
酶保存液
20 mM Tris-HCl, 50 mM NaCl, 1 mM DTT, 50% Glycerol, 0.1% (w/v) Triton X-100, pH 7.5。
相关产品
AE0101: Taq DNA Polymerase,AE1102 Thermolabile Uracil DNA glycosylase
应用举例
防止PCR产物污染的使用方法
1. 按如下表格配制PCR反应液
PCR 组份 | 体积/μl | 终浓度 |
10×Taq 酶 Buffer | 5 | 1× |
dNTPs(2.0 mM) | 5 | 0.2 mM |
dUTP(2.0 mM) | 1-5 | 0.04-0.2 mM |
引物 F(10 μM) | 1.5 | 0.3 μM |
引物 R(10 μM) | 1.5 | 0.3 μM |
Template | 1-5 | / |
热启动 Taq 聚合酶(5U/μl) | 0.5 | 2.5U |
UDG(5U/μl) | 0.5 | 2.5U |
ddH2O | Variable | / |
总体积 | 50 | / |
2. 37℃下反应10分钟,消除可能的dU-DNA污染物。
3. PCR反应。
警告: 本产品仅限科研实验使用,临床应用安全性和有效性未鉴定,不可用于医疗临床诊断
注意事项
l Ec UDG具有较强的耐热性,95℃保温10分钟可以失活95%酶活,但温度降低至常温,该酶会回复大部分活性。因此建议使用本公司的热敏UDG酶,或者酚氯仿抽提去除EcUDG。
l UDG切割含dU碱基的ssDNA活性最高,大概是dU/dA双链DNA的5-10倍,各种底物的活性顺序为:dU/dA < dU/dG < dU/dC ≈ dU/dT < ssDNA。
l 常温下可以用UDG抑制剂蛋白来抑制UDG的酶活性,但UDG抑制剂不耐高温,高温处理会失活UDG抑制剂,导致其不再抑制UDG的活性。
l UDG在较宽pH范围均有活性,最优pH 8.0,不需二价阳离子,高于200 mM NaCl抑制活性。
l 大肠杆菌 UDG酶的反应温度可以在 37-50℃ 的范围内变化,建议在 37℃反应,也可根据实验需要在 37-50℃范围内自由调整反应温度。
l UDG可以在 PCR反应前清除不慎污染的 U-DNA分子,对于某个DNA片段的 PCR扩增反应,整个操作室必须在所有操作批次的 PCR反应中添加 dUTP,使所有扩增产物都成为 U-DNA。如果仅某次 PCR扩增反应使用 dUTP,T-DNA仍积累,这个抗污染系统也难以起到完全的作用。
l UDG/dUTP系统是 PCR试剂专用的一种防污染措施,为了防止 PCR产物的污染,尤其是在临检实验室中反复扩增同一片段时,必须严格规范实验室的区域划分和操作。
l 如果经过换房间、紫外照射、DNase消化等措施后,依然对某个片段存在污染,建议在不同的扩增区重新设计引物,以错开污染片段。