Component | AQ0402A | AQ0402B | AQ0402C | AQ0402D |
一步法RT-qPCR 2×SuperMi(Taqman) | 1ml | 1ml×5 | 5ml×4 | 5ml×10 |
Nuclease free Water | 1ml | 5ml | 5ml×4 | 5ml×10 |
产品说明:
本产品一步法RT-qPCR 2×SuperMix(Taqman)用于RNA分子的定量分析,由于采用Taqman探针进行定量,消除了引物二聚体和非特异性扩增产物带来的假阳性误差。本产品包含MMLV RTase2.0、RNase Inhibitor、热启动型Taq DNA聚合酶、dNTPs和优化的反应缓冲液,浓度为2×。RT-qPCR 反应时,只需加入RNA模板、引物和DEPC处理水,使2×SuperMix溶液的浓度为1×即可进行反应。RNA分样本类型包括总RNA、mRNA、核糖体RNA、tRNA等。核心组分之一MMLV RTase2.0经基因工程改造,热稳定性显著提高,可以耐受55-60度,使得反转录反应可以在50-55度进行,从而消除了RNA二级结构对反转录的抑制作用。Buffer专门针对RT-qPCR进行了优化,MMLV RTase和Taq DNA聚合酶在该Buffer中均有较高活性,且Taqman探针释放信号高,非常适合于Taqman探针型一步法RT-qPCR。
特点:
• 一步法减少RT-qPCR操作时间。
• 避免因多步操作带来的污染。
• RNA片段的定量 (≤3 kb)。
• 热启动Taq酶,非特异性扩增导致的假阳性信号低,扩增效率高、稳定性好。
• 采用Taqman探针进行定量,消除了引物二聚体和非特异性扩增产物带来的假阳性。
• MMLV RTase2.0可以在50-55度反转录,从而消除了RNA二级结构对反转录的抑制作用。
适用范围:
RNA样品(mRNA、rRNA等)的RT-qPCR定量,Taqman探针型定量。
4度保存1个月;-20℃保存1年。
一步法 RT-PCR 将 RNA 反转录合成 cDNA、目标 cDNA 的 PCR 反应合二为一。以下反应举例为 50 μl 标准一步法RT-PCR 体系, 仅供参考。实际 RT-PCR 条件应根据模板、引物、目的片段大小加以优化,确定最佳反应条件。
1.在无RNase A污染的PCR管中配制如下混合液
Component | Volume | Final Concentration |
RT-qPCR 2×SuperMix(Taqman) | 25μl | 1× |
Forward Primer(10μM) | 1.5μl | 0.3μM |
Reverse Primer(10μM) | 1.5μl | 0.3μM |
Taqman探针(10μM) | 0.5-1.0μl | 0.1-0.2μM |
RNA Template* | Variable | as required |
dd H2O | Variable | - |
Total volume | 50μl | - |
* Total RNA 的使用量一般为 10 ng~1 μg;mRNA 的使用量一般为 1ng~1 μg
反应体系中各成分的量可根据以下原则自行调整:
l Taqman探针的浓度一般在0.05-0.2μM,可能需根据扩增基因和探针的不同而进行浓度优化。
l 一般来说反应体系中引物终浓度为0.2 μM即可得到较好的扩增效果。当反应性能比较差时,可以在终浓度0.1 - 1.0 μM范围内调整引物浓度。
2.按下列条件进行qPCR反应
(1)常规扩增条件
50℃ | 30min | 反转录 |
95℃ | 1 min | 预变性 |
95℃ | 5-10 sec | 循环扩增 30-40 Cycles |
50~60℃ | 15 sec | |
72℃ | 15 sec | |
72℃ | 1 min |
(2)退火延伸一步法扩增条件
50℃ | 30min | 反转录 |
95℃ | 1 min | 预变性 |
95℃ | 5-10 sec | 循环扩增 30-40 Cycles |
60-68℃ | 30 sec | |
72℃ | 1min |
注意事项
l 本反转录反应条件适合绝大多数RNA,如RNA模板结构复杂,可将反转录温度提高到55度,以提高反转录效果。
l PCR阶段常规变性时间选择10 sec;快速变性时间最短可选5 sec。
l 常规扩增条件的退火温度可以根据引物的Tm值进行调整,当Tm较高时可以提高退火温度,增加扩增条带的特异性。
l (1)常规扩增条件下,200-300 bp片段延伸时间72度15 sec,200 bp以内片段72度10 sec;(2)退火延伸一步法扩增条件下,200-300 bp片段延伸时间60度30 sec;200 bp以内片段延伸时间60度20 sec。
l 退火延伸一步法扩增条件下的引物Tm值需要高于延伸温度3-5度。
仪器类型不同,融解曲线采集程序不尽相同,使用仪器默认融解曲线采集程序即可。
注意事项:
l 本品在4度避光保存1个月内稳定,尽量避免反复冻融,以免造成酶活下降。如每次使用量较少,推荐小份分装使用。
l 使用前请上下颠倒以混匀Master Mix,短暂低速离心后即可使用。请勿vortex避免酶失活,影响定量结果。
l 加样过程中轻柔吹打,如果操作不慎导致SuperMix起泡,需离心方可使用。
l 本品使用时额外加入的Taqman荧光探针需避光,因此配制反应体系时应尽量避免强光照射。
l 为了防止环境DNA的污染,反应体系配制时请于超净工作台内进行,配制过程中请使用灭菌枪头、反应管。
l 由于本品检测灵敏度极高,易被空气中气溶胶污染。因此如经常检测某些特定基因,为了避免气溶胶污染,建议使用本公司的 UDG型 Taqman探针型一步法RT-qPCR 2×SuperMix (AQ0412系列)