产品说明
热稳定核酸内切酶 IV 来源于嗜热细菌,为脱嘌呤/脱嘧啶(AP)位点特异性的核酸内切酶。该酶切割 AP 位点 5´ 端的第一个磷酸二酯键,产生 3´ 羟基和 5´ 脱氧核糖磷酸末端。除天然的AP位点外,各种人工合成的Spacer分子也能够被内切核酸酶IV有效切割,包括THF、Spacer C3、Spacer C12、Spacer 9,Spacer 18等。该酶也具有 3´二酯酶活性,能从 DNA 的 3´末端释放磷酸甘油醛(phosphoglycoaldehyde)、α,β-不饱和醛(α,β-unsaturated aldehydes)、3’-磷酸、其它3' blocking groups。该酶还能够作用于 DNA 分子上的几种氧化性损伤,水解氧化损伤碱基的5’端第一个磷酸二酯键。 另外,该酶还具有3´-5´的外切酶活性。酶活性受到金属离子、DTT、EDTA等的影响,优先作用于3´凹末端的双链DNA。
本公司热稳定核酸内切酶 IV是在大肠杆菌中重组表达,并亲和纯化的重组蛋白。
活性定义
1 单位指在65℃ 条件下,1小时能切割 1 pmol 含一个 AP 位点的 34 bp 荧光标记的寡核苷酸双链所需要的酶量。
AP 位点的制备方法如下:37℃条件下,用1U尿嘧啶-DNA 糖基化酶(UDG)处理 10 pmol 含一个尿嘧啶碱基的34 bp寡核苷酸双链2分钟。
活性测定:
1× AM Buffer E:10 mM KCl,20 mM Tris-HCl,10 mM (NH4)2SO4,2 mM MgSO4,0.1% Trition X-100(pH 8.8 @ 25℃),65℃ 温育。
浓度:10U/μl
保存条件:-20℃保存
特点
Ø 具有很好的热稳定性,可以在65-75℃反应;
Ø 在多种反应体系中均有活性。
适用范围
Ø 与高温UDG一起改善高忠实性DNA聚合酶PCR扩增性能
Ø 单细胞凝胶电泳(彗星试验);
Ø 切断合成的寡核苷酸中各种Spacer,例如,Spacer C3,Spacer C18,Spacer 9等;
Ø 修复损伤的DNA。
产品包装规格及组成
Component | AE1142A | AE1142B |
Tth内切核酸酶IV | 500U | 2.5kU |
10×AM BufferE | 0.2ml | 1ml |
质量控制
相关测试表明无外源内切、外切脱氧核糖核酸酶、RNase污染。PCR方法检测无宿主残余DNA。
酶贮存缓冲液
20 mM Tris-HCl,150 mM NaCl,1 mM DTT,0.1 mM EDTA,50% Glycerol, pH 8.0 @ 25°C。
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应用举例
1、改善PCR扩增效果
1. 按如下表格配制PCR反应液
PCR 组份 | 体积/μl | 终浓度 |
10×Pfu酶Buffer | 5 | 1× |
dNTPs(2.0 mM) | 5 | 0.2 mM |
引物F(10 μM) | 1.5 | 0.3 μM |
引物R(10 μM) | 1.5 | 0.3 μM |
Template | 1-5 | / |
Pfu DNA聚合酶(2U/μl) | 0.5 | 1U |
耐热UDG(2U/μl) | 1.0 | 2U |
Tth内切核酸酶IV(10U/μl) | 1.0 | 10U |
ddH2O | Varable | / |
总体积 | 50 | / |
2. PCR反应。
警告: 本产品仅限科研实验使用,临床应用安全性和有效性未鉴定,不可用于医疗临床诊断。
注意事项
l 该酶的最佳反应温度为65-70°C。该酶与PCR反应条件兼容。
l 彗星试验的推荐稀释度:1:104-1:105。
l Endo IV最佳缓冲液为1× AM Buffer C。该酶在AM Buffer B中的活性为100%,在AM BufferD2缓冲液中的活性为25%。不建议在AM BufferA中使用Endo IV。
l 本酶为高温酶,不能直接热失活。若需失活该酶可以进行酚氯仿抽提,或加入终浓度50mM EDTA并在95℃ 加热 20 分钟。
l 本酶有高浓度包装(200U/ul),在用于改善PCR扩增效果时建议使用高浓度包装,且每个PCR反应加入量为20-200U。
l 用于改善PCR扩增效果时,其原理如下:高温UDG切除dU碱基产生无碱基AP位点,高温内切核酸酶IV断裂AP位点,并由DNA聚合酶进行延伸,修复成全长DNA片段。
l 本酶活性随温度升高而增强,具体应用建议在不同温度下摸索酶具体用量。
l 酶稀释缓冲液: 100 mM KCl, 10 mM Tris-HCl (pH 7.4 @ 25°C), 0.1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.1% Triton X-100 and 50% glycerol.