产品说明
外切核酸酶III作用于双链 DNA,从 3´ OH 末端方向逐步切去单核苷酸。每次酶与底物结合催化,只有几个核苷酸被除掉,从而在 DNA 分子群内产生渐进式3’端缺失。
尽管可以作用于双链 DNA 的切刻产生单链缺口,但该酶最适底物是平齐末端或 3´ 凹陷末端 DNA。由于对单链 DNA 无活性,因此该酶无法切割 3´ 突出末端。3´ →5´ 外切酶活性对底物的切割程度随 3´ 突出末端的长度而变化,四碱基或更长的突出末端完全不能被切割。
核酸外切酶 III 的活性部分依赖DNA双螺旋结构,并根据序列的不同而有差异(C>A=T>G)。温度、盐浓度和酶与 DNA的比例对酶活性影响很大,应根据不同的反应调整反应条件。
核酸外切酶 III 也有 RNase H、3´ -磷酸酶、脱嘌呤/嘧啶(AP)位点特异性核酸内切酶活性。
本公司Exonuclease III是重组表达,并经多步纯化制备的重组蛋白。
活性定义
1活性单位指在37℃条件下, 30 min内催化生成1nmol酸可溶性总核苷酸所需的酶量。
活性测定条件
1×AM BufferA: 10 mM Bis-Tris,10 mM MgCl2,1 mM DTT(pH 7.0)
浓度:100U/μl
保存条件:-20℃可保存2年,避免反复冻融
特点与适用范围
Ø 3´ →5´ 外切酶活性
Ø 双链DNA的非定向巢式缺失
Ø RPA扩增中荧光探针的降解,释放荧光信号
Ø 制备用于双脱氧测序的单链模板
产品包装规格及组成
Component | AE2102A | AE2102B |
Exonuclease III | 2500U | 12500U |
10×AM Buffer A | 0.2ml | 1.0ml |
质量控制
经过严格的质控检测,确保该产品具有最高的活性和纯度。
酶贮存缓冲液
200 mM KCl,5 mM KPO4,5 mM β-ME,0.05 mM EDTA,200 µg/ml BSA,50% Glycerol (pH 6.5@25℃)。
相关产品
AE2101: lambda exonuclease
应用实例
1. 酶切反应
1)按下表配制反应体系
反应组分 | 体积/ul |
10× Buffer | 5 |
平末端或5’突出端(3’ 凹陷末端)DNA | 2-5ug |
Exonuclease III (100U/µl) | 1 |
H2O | variable |
总体积 | 50 |
2)37°C反应30min;
3)75°C加热10min,使酶失活
4)电泳检测双链DNA水解结果。
2. RPA荧光释放反应
1)按下表配制反应体系
反应组分 | 体积/ul |
10 × RPA Buffer | 5 |
RPA Mix | Xul |
5 | |
RPA引物R(10uM) | 5 |
RPA荧光探针(10uM) | 1 |
Exonuclease III (100U/µl) | 1 |
H2O | variable |
总体积 | 50 |
2)在荧光检测仪(qPCR仪)中37°C反应15-60min;
3)观测荧光曲线。
警告: 本产品仅限科研实验使用,临床应用安全性和有效性未鉴定,不可用于医疗临床诊断。
注意事项
l 核酸外切酶 III 不能切割硫代磷酸酯键。因此,也可以通过引入一个 α-硫代磷酸核苷酸将 DNA 分子的一端保护起来,以进行单向切割。
l 这种特性可以用于对一端为钝化末端(3´ 突出端),另一端是敏感末端(平端或 5´ 突出端)的线性 DNA 分子进行单方向切割。
l 在如下Buffer中的活性为:AM Buffer 1:100%,AM Buffer 2:75%,AM Buffer 3:25%,AM Buffer 4:75%,AM Buffer 4.1:100%