T4 RNA连接酶2,截短型KQ(T4 Rnl2tr KQ)能特异性将5´末端预腺苷化的DNA或RNA连接到RNA的3´OH末端。反应无需ATP,但需预腺苷化接头。
T4 Rnl2tr KQ是T4 RNA连接酶2,截短型的双点突变体。 K227的突变降低了赖氨酰腺苷化。由于降低了T4 Rnl2tr从接头将腺苷基团转移到RNA 5´磷酸基的活性,K227Q可以减少T4 Rnl2tr 非特异性的连接(串联体和环)。在T4 Rnl2tr K227Q中进一步突变R55K,提高了酶的连接活性,使其与野生型T4 Rnl2tr连接活性水平一致。
因为不再使用ATP,而改用预腺苷化接头,同时降低赖氨酰腺苷化酶的活性,所以连接反应的背景可以降至最低。该酶已用于二代测序 Small RNA的文库构建中,优化了接头的连接过程。
本公司T4 RNA 连接酶2,截短型KQ是重组表达,并经多步纯化制备的重组蛋白。
活性定义
200活性单位指在25℃,1×T4 RNA连接酶反应缓冲体系(20ul),60 min内将80%的31-mer RNA(5´-FAM-rArGrUrCrGrUrArGrCrCrUrUrUrArUrCrCrGrArGrArUrUrCrArGrCrArArUrA-3´ )连接到预腺苷化的miRNA通用克隆接头17-mer DNA(5´-rAppCTGTAGGCACCATCAAT–NH2-3´,14μM)末端所需的酶量。
活性测定条件
1× T4 RNA连接酶2反应缓冲液:50 mM Tris-HCl (pH7.5 @ 25℃),10 mM MgCl2,1 mM DTT,10% (w/v) PEG 8000, 20 pmol of 5´-FAM-RNA, 40 pmol 预腺苷化DNA,25℃温育60min。
浓度:200U/μl
保存条件:-20℃可保存2年,避免反复冻融
特点与适用范围
Ø 将预腺苷化的DNA或RNA序列标签连接到任何RNA 3´末端
Ø 将单链腺苷化引物连接至小RNA上,用于cDNA文库构建
Ø 将单链腺苷化引物连接至RNA上,用于链特异cDNA文库构建
产品包装规格及组成
Component | AE1355A | AE1355B |
T4 RNA连接酶2,截短型KQ | 2000U | 10kU |
10× T4 RNA连接酶2 Buffer | 0.2ml | 1.0ml |
50% PEG8000 | 0.2ml | 1.0ml |
质量控制
相关测试表明无外源单链和双链 DNA 核酸内切酶、外切酶、 RNase 以及磷酸酶的污染。PCR方法检测无宿主残余DNA。
酶贮存缓冲液
10 mM Tris-HCl,100 mM NaCl,1 mM DTT,0.1 mM EDTA,50% Glycerol,pH 7.5 @ 25°C
使用实例:3´ OH of RNA和5´预腺苷化DNA linker连接反应
1)按下表配制反应体系
反应组分 | 体积或浓度 |
10×T4 RNA连接酶2 Buffer | 2ul |
RNA底物(10µM) | 2ul |
5´预腺苷化DNA linker(20µM) | 2ul |
50% PEG8000* | 4ul |
酶(200 U/µl) | 1-2ul |
无核酸酶H2O | Yul |
总体积 | 20ul |
2)25℃×1-2h反应,
3)添加蛋白酶K或终浓度20mM EDTA失活酶,
4)尿素变性PAGE电泳检测酶切产物,或按实验目的进行后续操作。
* 为了提高连接效率,PEG8000 浓度可以高达25%
警告: 本产品仅限科研实验使用,临床应用安全性和有效性未鉴定,不可用于医疗临床诊断。
注意事项
l 热失活:65℃温育20分钟。
l 可加入核酸酶抑制剂防止RNA污染。