T4 RNA连接酶2,截短型(T4 Rnl2截短型)可特异性地将5´端预腺苷化的DNA或RNA连接到RNA的 3´末端。该酶连接时不需要ATP,但需要预腺苷化底物。T4 Rnl2截短型来自于T4 RNA连接酶2基因的前249个氨基酸。与全长的T4 RNA连接酶2不同,T4 Rnl2截短型不能将底物的5´末端腺苷化,因此无法将5´末端磷酸化RNA或DNA连接到 RNA的3´端。截短型T4 Rnl2(1-249),可用于microRNA 克隆中接头连接的优化,且只能利用腺苷化的引物,因此可以降低连接背景。
本公司T4 RNA 连接酶 2,截短型是重组表达,并经多步纯化制备的重组蛋白。
活性定义
200活性单位指在25℃,1×T4 RNA连接酶反应缓冲体系(20ul),60 min内将80%的31-mer RNA(5´-FAM-rArGrUrCrGrUrArGrCrCrUrUrUrArUrCrCrGrArGrArUrUrCrArGrCrArArUrA-3´ )连接到预腺苷化的miRNA通用克隆接头17-mer DNA(5´-rAppCTGTAGGCACCATCAAT–NH2-3´,14μM)末端所需的酶量。
活性测定条件
1× T4 RNA连接酶2反应缓冲液:50 mM Tris-HCl (pH7.5 @ 25℃),10 mM MgCl2,1 mM DTT,10% (w/v) PEG 8000, 20 pmol of 5´-FAM-RNA, 40 pmol 预腺苷化DNA,25℃温育60min。
浓度:200U/μl
保存条件:-20℃可保存2年,避免反复冻融
特点与适用范围
Ø 将预腺苷化的DNA或RNA序列标签连接到任何RNA 3´末端
Ø 将单链腺苷化引物连接至小RNA上,用于cDNA文库构建
Ø 将单链腺苷化引物连接至RNA上,用于链特异cDNA文库构建
产品包装规格及组成
Component | AE1353A | AE1353B |
T4 RNA连接酶2,截短型1-249 | 2000U | 10kU |
10× T4 RNA连接酶2 Buffer | 0.2ml | 1.0ml |
50% PEG8000 | 0.2ml | 1.0ml |
质量控制
相关测试表明无外源单链和双链 DNA 核酸内切酶、外切酶、 RNase 以及磷酸酶的污染。PCR方法检测无宿主残余DNA。
酶贮存缓冲液
10 mM Tris-HCl,100 mM NaCl,1 mM DTT,0.1 mM EDTA,50% Glycerol,pH 7.5 @ 25°C
使用实例:3´ OH of RNA和5´预腺苷化DNA linker连接反应
1)按下表配制反应体系
反应组分 | 体积或浓度 |
10×T4 RNA连接酶2 Buffer | 2ul |
RNA底物(10µM) | 2ul |
5´预腺苷化DNA linker(20µM) | 2ul |
50% PEG8000* | 4ul |
酶(200 U/µl) | 1-2ul |
无核酸酶H2O | Yul |
总体积 | 20ul |
2)25℃×1-2h反应,
3)添加蛋白酶K或终浓度20mM EDTA失活酶,
4)尿素变性PAGE电泳检测酶切产物,或按实验目的进行后续操作。
* 为了提高连接效率,PEG8000 浓度可以高达25%
警告: 本产品仅限科研实验使用,临床应用安全性和有效性未鉴定,不可用于医疗临床诊断。
注意事项
l 热失活:65℃温育20分钟。
l 可加入核酸酶抑制剂防止RNA污染。