T4 RNA连接酶 2,也被称为 T4 Rnl2(gp24.1),同时具有 RNA 链分子间和分子内连接活性。与 T4 RNA 连接酶 1(NEB #M0204)不同的是, T4 RNA 连接酶 2 对双链 RNA 切刻的连接活性要明显高于对单链 RNA 的末端连接。该酶也可用于连接双链结构中 RNA 3´ 羟基和 DNA 5´ 磷酸基的切刻。
本公司T4 RNA 连接酶 2,截短型是重组表达,并经多步纯化制备的重组蛋白。
活性定义
1 单位指 20 μl 反应体系中, 37℃ 条件下, 30 分钟完全连接 0.4 μg 的 23-mer 和 17-mer RNA等摩尔混合物所需的酶量。
活性测定条件
1× T4 RNA 连接酶 2 反应缓冲液[50 mM Tris-HCl (pH 7.5 @ 25℃),2mM MgCl2,1 mM DTT,400 μM ATP], 0.4 μg 的 23-mer 和 17-mer RNA等摩尔混合物,37℃ 温育。
浓度:10U/μl
保存条件:-20℃可保存2年,避免反复冻融
特点与适用范围
Ø 连接粘性末端接头
Ø DNA或RNA序列连接到任何RNA 3´末端
Ø 用于 DNA/RNA 杂交链中,RNA 3´ 羟基与 DNA 5´ 磷酸基的连接
Ø 连接双链 RNA 中切刻
产品包装规格及组成
Component | AE1353A | AE1353B |
T4 RNA连接酶2 | 150U | 750U |
10× T4 RNA连接酶Buffer | 0.2ml | 1.0ml |
50% PEG8000 | 0.2ml | 1.0ml |
质量控制
相关测试表明无外源单链和双链 DNA 核酸内切酶、外切酶、 RNase 以及磷酸酶的污染。PCR方法检测无宿主残余DNA。
酶贮存缓冲液
10 mM Tris-HCl,50 mM KCl,35mM (NH4)2SO4, 0.1 mM DTT,0.1 mM EDTA,50% Glycerol,pH 7.5 @ 25°C
使用实例:3´ OH of RNA和5´磷酸化DNA linker连接反应
1)制备DNA/RNA切刻型底物:将等摩尔比例的DNA/RNA混合物在65度加热3min,在冰上放置2min。制备DNA/RNA切刻型底物可以立即使用,也可以保存在-20度备用。
2)按下表配制反应体系
反应组分 | 体积或浓度 |
10×T4 RNA连接酶Buffer | 2ul |
MgCl2 (100mM) | 1.6 µl |
Nicked DNA/RNA Substrate (10 µM) | 2ul |
50% PEG8000* | 4ul |
T4 RNA Ligase 2 (10 U/µl) | 1ul |
无核酸酶H2O | 9.4ul |
总体积 | 20ul |
3)25℃×1h反应,
3)添加蛋白酶K或终浓度20mM EDTA失活酶,
4)尿素变性PAGE电泳检测酶切产物,或按实验目的进行后续操作。
* 为了提高连接效率,PEG8000 浓度可以高达25%
使用实例:dsRNA中切刻的连接
1)制备dsRNA切刻型底物:将等摩尔比例的dsRNA混合物在65度加热3min,在冰上放置2min。制备dsRNA切刻型底物可以立即使用,也可以保存在-20度备用。
2)按下表配制反应体系
反应组分 | 体积或浓度 |
10×T4 RNA连接酶Buffer | 2ul |
Nicked dsRNA Substrate (10 µM) | 2ul |
T4 RNA Ligase 2 (10 U/µl) | 1ul |
无核酸酶H2O | 15ul |
总体积 | 20ul |
3)25℃×1h反应,
3)添加蛋白酶K或终浓度20mM EDTA失活酶,
5)尿素变性PAGE电泳检测酶切产物,或按实验目的进行后续操作。
警告: 本产品仅限科研实验使用,临床应用安全性和有效性未鉴定,不可用于医疗临床诊断。
注意事项
l 热失活:80℃温育20分钟。
l 可加入核酸酶抑制剂防止RNA污染。