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CircLigase
ssDNA/RNA 环化连接酶为热稳定的DNA/RNA连接酶,不依赖于ATP,可催化单链DNA或单链RNA的环化,也可催化其分子间连接,但其对单链DNA的连接效率更高。环化反应中,要求催化底物单链DNA/RNA具有5’-磷酸基团和3’-OH基团。对于大于15nt的单链底物,该酶都能高效的连接。该酶还可催化DNA或RNA分子与预腺苷化的DNA接头之间的连接,另外,在ATP过量的情况下,该酶可使DNA/RNA分子腺苷化。 本公司ssDNA/RNA环化连接酶是重组表达,并经多步纯化制备的重组蛋白。
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AE1358A 2000U ¥660
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AE1358B 10KU ¥2640
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ssDNA/RNA 环化连接酶为热稳定的DNA/RNA连接酶,不依赖于ATP,可催化单链DNA或单链RNA的环化,也可催化其分子间连接,但其对单链DNA的连接效率更高。环化反应中,要求催化底物单链DNA/RNA具有5’-磷酸基团和3’-OH基团。对于大于15nt的单链底物,该酶都能高效的连接。该酶还可催化DNARNA分子与预腺苷化的DNA接头之间的连接,另外,在ATP过量的情况下,该酶可使DNA/RNA分子腺苷化。

本公司ssDNA/RNA环化连接酶是重组表达,并经多步纯化制备的重组蛋白。

活性定义

1个活性单位为60°C1小时内催化1pmol 5’-磷酸化Oligo (55mer)完全环化所需的酶量。

活性测定条件

30mM Tris-acetate (pH 7.5), 60mM potassium acetate, 1mM DTT65℃温育。

浓度:100U/ul

保存条件:-20℃可保存2年,避免反复冻融

特点与应用

 

产品包装规格及组成

Component

AE1358A

AE1358B

ssDNA/RNA环化连接酶

2kU

10kU

10×环化酶Buffer

0.2ml

1.0ml

50 mM   MnCl2

0.2ml

1.0ml

质量控制

经过严格的质控检测,无单链DNA核酸外切酶、核酸内切酶、RNase和磷酸酶污染

酶贮存缓冲液

20 mM Tris-HCl, pH 8, 50 mM KCl, 1 mM DTT and 0.1 mM EDTA, 50% glycerol.


使用实例:

1)按下表配制反应体系

反应组分

体积或浓度

10×CircLigase   Buffer

2ul

50 mM MnCl2 

1ul

5’磷酸化 ssDNA/RNA

10-100   pmol

CircLigase   (100 U/μl)

1-2ul

H2O

Xul

总体积

20ul

265℃×60min反应,

3加入1 µl Proteinase K, 37°C温育15min,或85°C加热10min失活酶,或加入10mM EDTA终止反应。Proteinase K 有助于释放被连接酶结合的RNA

4)尿素变性PAGE电泳检测连接产物,或按实验目的进行后续操作。

经典环化结果(50nt ssDNA)如下


泳道1为未加环化酶,2为加入环化酶,3为环化产物加入ExoI酶消化产物。

警告: 本产品仅限科研实验使用,临床应用安全性和有效性未鉴定,不可用于医疗临床诊断。

 

 


注意事项

l  添加终浓度20-50μMATP可提高环化效率ATP终浓度高于 20μM 以上时会极大抑制环化效率,甚至导致环化失败),高于1mM ATP浓度会抑制连接反应。

l  对于单链DNA产物的连接,需要加入终浓度2.5mM MnCl2

l  5’端未磷酸化的底物不能用于连接,3’端无-OH的底物不能用于连接。即环化底物 ssDNA  RNA 必须带有 5’磷酸基团,3’端含有 OH

l  对于含有二级或复杂结构的连接底物,可加入0.4~0.8 M Betain以提高连接效率。不过本公司结果表明Betain没有提升连接效率

l  该酶对底物碱基具有选择性,5’末端连接效率: G > A >>> T (U)>>> C3’末端连接效率T(U) > A > G,当3’端的碱基为C时不能用于连接,几乎无连接产物。

l  本酶对 ssDNA  RNA 的环化效率极高,多数情况下, 90%以上的底物被环化。未被环化的 ssDNA 可通过加入 5U 本公司Exonuclease IAE2202),37°C 消化 15min 去除,以获得高纯度的环化 ssDNA。未环化的 ssRNA,可利用本公司的RNase R去除。

l  对于连接底物量较少的实验来讲,推荐缩小体系,而不是减少酶的用量。在小体系实验时注意体系的蒸发,可加入矿物油以防止蒸发。


CircLigase
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ssDNA/RNA 环化连接酶为热稳定的DNA/RNA连接酶,不依赖于ATP,可催化单链DNA或单链RNA的环化,也可催化其分子间连接,但其对单链DNA的连接效率更高。环化反应中,要求催化底物单链DNA/RNA具有5’-磷酸基团和3’-OH基团。对于大于15nt的单链底物,该酶都能高效的连接。该酶还可催化DNA或RNA分子与预腺苷化的DNA接头之间的连接,另外,在ATP过量的情况下,该酶可使DNA/RNA分子腺苷化。 本公司ssDNA/RNA环化连接酶是重组表达,并经多步纯化制备的重组蛋白。
2000U